Oxford Nanopore veröffentlicht Short Fragment Mode: ein neues Werkzeug zur Echtzeit-Sequenzierung kurzer DNA-Fragmente
Heute wird der Short Fragment Mode in die Betriebssoftware integriert, die Nanoporengeräte antreibt, was die Sequenzierung von Fragmenten von nur 20 Basen auf Nanoporenplattformen ermöglicht.
OXFORD, ENGLAND / ACCESSWIRE / 23. März 2022 / Mit der Nanoporentechnologie ist es möglich, kurze bis ultralange DNA-Fragmente zu sequenzieren. Jüngste Softwareentwicklungen haben es Oxford Nanopore ermöglicht, die Fähigkeit zu "erschließen", die kürzesten DNA-Fragmente mit einer Länge von bis zu 20 Basen zu sequenzieren.
Nach der heutigen Veröffentlichung der MinKNOW 22.03-Software erhalten alle Kunden sofort und ohne zusätzliche Kosten Zugriff auf die erste Version des Short Fragment Mode (SFM). Da das Update das Ergebnis von Software- und nicht von Chemie-Updates ist, benötigen Benutzer keine neuen Sequenzierungsreagenzien oder -geräte, um die Vorteile von SFM zu nutzen.
Die Nanoporentechnologie wurde entwickelt, um es einem Benutzer zu ermöglichen, die Länge der DNA-Fragmente, die er der Pore präsentiert, zu sequenzieren. Nachdem bereits gezeigt wurde, dass die Sequenzierung mehr als vier Megabasen lang ist, ist die Nanoporensequenzierung die einzige Technologie auf dem Markt, die in der Lage ist, DNA-Längen über fünf Größenordnungen in einer einzigen Technologie zu sequenzieren. Vom Einweg-Flongle bis zum Hochdurchsatz-PromethION wird SFM in dem Umfang verfügbar sein, den Anwender benötigen, um ihre wichtigsten biologischen Fragen zu beantworten.
Der Short Fragment-Modus ist auch mit der Fähigkeit von Oxford Nanopore gekoppelt, hohe Ausgaben pro Durchflusszelle (mit über 250 Millionen Messwerten, die auf einer einzigen PromethION-Flusszelle demonstriert wurden) an informationsreichen Daten zu erzeugen. Benutzer können jetzt mit dem neuesten Methylierungsnachweiswerkzeug Remora problemlos auf Methylierungsinformationen von kurzen Molekülen wie zellfreier DNA zugreifen.
Diese neueste Version ermöglicht es Benutzern, hochpräzise informationsreiche Daten über jedes Molekül von 20 Basen bis zu Millionen von Basen längen mithilfe der Nanoporentechnologie zu generieren. Das Team freut sich auf die Zusammenarbeit mit der Nanopore Community, um die Fähigkeit dieser Methode zur Entdeckung neuer Bereiche der Biologie zu demonstrieren.
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Anwendungen im Kurzfragmentmodus: https://nanoporetech.com/applications/short-fragment-mode
Kontakt: media@nanoporetech.com
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QUELLE: Oxford Nanopore Technologies plc
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https://www.accesswire.com/694355/Oxford-Nanopore-Releases-Short-Fragment-Mode